Origine, Structure et Evolution de la Biodiversité
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Personnel
COMPOSITION DE L’EQUIPE GPS3
Cette équipe entrecroise le laboratoire de Biologie intégrative des populations de l’EPHE, présent également au laboratoire d’Ecologie (UMR 7625) de l’UPMC.
Enseignants-chercheurs
Michel Veuille, DE EPHE
Thierry Wirth, DE EPHE
Thierry Deuve, MCF MNHN
Stefano Mona, MCF EPHE
Anna de Grassi, MCF EPHE (sous réserve de nomination en novembre 2011)
Claudie Doums, MCF EPHE (affectée à l’UMR 7625, Jussieu)
Stephane Prigent, ATER EPHE
Ingénieurs
Lionel Brazier, IE CNRS
Arnaud Suwalski, IE EPHE
Thésards/Master/stagiaires
Axelle Bouiges, Doctorante ED 472 (EPHE)
Simone Fernandes, Doctorante ED 472 (EPHE)
Florent Meli, doctorant ED 472 (EPHE)
Ont quitté le laboratoire cette année
Aude Gilabert, ATER EPHE
Juliette Arabi, ATER EPHE
Maya Ikogou, Master 2 (EPHE)
Axelle-Rolande Sikoa, Master 1 (EPHE)
Paul Simion, stagiaire
Retour à la page de l’équipe (GPS3)
Michel, Axelle, Arnaud, Stefano, Stéphane, Maya, Axelle-Rolande, Florent, Thierry (W), Juliette, Aude, Lionel, Simone, Camille, Thierry (D).
Il manque Paul, qui n’a pas donné sa photo ..
Séminaire d’équipe : bilan des recherches de l’année des ATER, thésards et stagiaires de master ; mai-juin 2011.
Evenements de l’année 2010-2011
Stefano Mona
a obtenu un poste de Maître de conférences de l’ Ecole pratique des hautes études. Sa spécialité porte sur les approches théoriques en génétique moléculaire des populations, notamment par l’utilisation des méthodes ABC (méthodes bayesiennes approchées). Il a soutenu sa thèse à Bari (Italie), et effectué plusieurs postdocs en Italie et en suisse (Laboratoire Bertorelle, Barbujani, Excoffier). Au sein de l’équipe, il est associé aux projets ANR C3A et CORALFISH. Il termine un travail sur la combinaison des changements démographiques et de la structuration des populations à plusieurs échelles sur les profils de variablité moléculaire.
Stéphane Prigent
a rejoint l’équipe en tant que chercheur contractuel. Il a soutenu une thèse à Gif-sur-Yvette sur l’adaptation alimentaire des drosophiles mycophages. Il a ensuite effectué plueiurs post-doctorats en Asie du sud-est (Japon, Taipeh). Il a mis ses compétence en systématique des insectes au bénéfice du dépouillement de données sur l’abondance des drosophilides de la forêt tropicale humide du mont Oku (Cameroun, province du Nord-Ouest). Sur ce site, des relevés ont été faits à plusieurs élévations sur un cylce annuel complet. Cela permettra de mieux connaître la distribution de 60 espèces de drosophilides en fonction des saisons (saison humide, saison des pluies) et de l’altitude (entre 2000 et 2800 mètres), et d’utiliser ces données pour mieux interpréter les fluctuations démographiques passées de ces organismes en fonction des changements climatiques. C’est une collaboration avec Michel Veuille, Shay Wilfried (Oku village) et Philippe Le Gall (IRD, Yaoundé).
Axelle Bouiges
a commencé une thèse de doctorat en septembre 2011dans le cadre du projet ANR C3A. Son sujet porte sur la détection de la signature des changements démographique consécutifs aux changements climatiques récents (Holocène) dans le génome des espèces de la forêt humide africaine. Son modèle biologique est la famille des Drosophilidae (Drosophila, Zaprionus. Entre deux séries de manips de biologie moléculaire, Axelle effectue des campagnes d’échantillonnage. Cette année est allée échantillonner des espèces d’altitude (1600-2000m) dans la forêt primaire du Mont Kupé (Photo) et du Mont Cameroun. On pense que la connectivité entre les populations des différents sommets aurait pu être rompue au cours de l’Holocène. L’étude génétique de leurs relations de migrations pourrait ainsi nous renseigner sur la dynamique de la biodiversité au cours des derniers millénaires.
Maya Ikogou,
boursière du Gabon, a obtenu son Master 2 en environnement et gestion de la biodiversité. Son stage portait sur la délimitation des espèces de Zaprionus de la forêt gabonaise, et sur la détection de l’expansion des populations du complexe Zaprionus indianus dans la forêt d’Afrique centrale. Ses résultats de M1 montrent que le barcode moléculaire (locus COI) révèle de nombreuses espèces ne corespondent pas à des taxons connus. La diversité taxonomique réelle serait environ double de celle qui est identifiée. Ses résultats de M2 montrent que l’espèce envahissante Zaprionus indianus a connu une expansion de population au cours de l’Holocène, mais l’imperfection de l’horloge moléculaire actuellement disponible ne permet pas encore de dire si le début de cette expansion concorde avec un changement climatique identifié. Son travail s’intègre à une collaboration EPHE-IRET dans le cadre du programme IFORA
Axelle-Rolande Sikoa,
boursière du Gabon, a mené à bien sa première année de master, sur l’étude de la structuration génétique des espèces du complexe Zaprionus david dans la forêt humide d’Afrique centrale. Ses études ont essentiellement porté sur le polymorphisme de séquences du locus COI. Ils ont comporté une partie morphologique, indispensable pour intégrer les individus étudiés à la base de données du laboratoire (Photo). Ses résultats montrent que les espèces de Zaprionus du complexe davidi ont systématiquement uen diversité moléculaire plus faible que celles du complexe indianus. L’espèce Z. taronus est fragmentéeen de nombreuses populations très différencies entre elles d’ans l’espace forestier. Son travaille s’intègre à un collaboration EPHE-IRET dans le cadre du projet C3A.
Michel Veuille,
a été élu doyen de la section Sciences de la vie et de la terre de l’Ecole pratique des hautes études. Avec les doyens des deux autres sections (Sciences historiques et philologiques et Sciences religieuses), il assiste le Président de l’établissement Jean-Claude Waquet, pour le passage de l’établisement aux responsabilités et compétences élargies. Il partage son temps entre la politique de la recherche et son métier d’enseignant-chercheur (direction de l’équipe GPS3, cours de génétique des population et d’histoire de la théorie de l’évolution). Ici, lors d’une mission de Coralspot aux îles Gambier.
Echantillonnage aux îles Gambier : projet Coralspot sur les espèces endémiques
Avec Jean-Claude Waquet, président de l’EPHE (cérémonie de remise de doctorats honoris causa)
Echantillonnage au Cameroun : projets IFORA et C3A.
