Origine, Structure et Evolution de la Biodiversité
UMR 7205 MNHN/CNRS
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Pôles techniques et méthodologiques
Trois pôles techniques et une plate-forme sont aujourd’hui à disposition des chercheurs de l’OSEB :
Le pôle Cytogénétique évolutive, responsable Florence Richard
Le Service de Systématique Moléculaire (S.S.M.) , responsable Eric Pasquet, pour les analyses moléculaires. Le S.S.M. est une plate-forme indépendante de l’UMR 7205.
La plate-forme de Morphométrie, responsable Michel Baylac, pour les approches morphométriques.
Un supercalculateur modulaire, responsable Cyrille D’Haese, pour l’analyse de gros jeux de données et la mise en oeuvre de nouvelles approches d’analyse phylogénétique de type homologie dynamique.
Cytogénétique évolutive
Le pôle de cytogénétique évolutive est très lié aux recherches développées par Bernard Dutrillaux, Florence Richard et Vitaly Volobouev, mais ouvert aux collaborations extérieures. Plusieurs étudiants y ont travaillé et y travaillent actuellement l’évolution chromosomique de leurs groupes d’étude. Une étape importante a été la mise au point de techniques efficaces pour l’analyse des chromosomes de coléoptères, ouvrant la voie à l’utilisation des marqueurs chromosomiques pour l’étude de l’évolution de ce (...)
Grappe de calcul parallèle (cluster)
Les approches phylogénétiques sont des problèmes type NP-complet (Garey & Johnson, 1977). Les analyses intégrant un nombre raisonnable de gènes et de taxons représentent un véritable défi informatique puisqu’elles nécessitent des temps de calculs incompatibles avec les équipements informatiques classiques.
Actuellement, le traitement des données impose soit une limitation du nombre de taxons soit une limitation du nombre de descripteurs, deux solutions inacceptables pour le développement des (...)
